Yazar "Demir, Cemil" seçeneğine göre listele

Listeleniyor 1 - 3 / 3
  • Küçük Resim
    Öğe
    Karbapeneme Dirençli Acinetobacter baumannii Suşlarında OXA Tipi Karbapenemaz Genlerinin Dağılımının Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu Yöntemiyle İncelenmesi
    (AVES, 2019) Demirci, Mehmet; Yiğin, Akın; Demir, Cemil
    Amaç: Karbapenemler, Acinetobacter baumannii infeksiyonlarının tedavisinde kullanılan en önemli geniş spektrumlu antibiyotiklerdir. Fakat dünya genelinde karbapenemlere direnç gittikçe artmaktadır. Bu çalışmamızda, karbapenem direnci saptanan A. baumannii suşlarında gözlenen OXA tipi karbapenemaz genlerinin dağılımını, gerçek zamanlı polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) yöntemiyle incelemeyi ve epidemiyolojik veri sunmayı amaçladık. Yöntemler: Ocak 2016-Ocak 2018 arasında klinik örneklerden izole edilen karbapeneme dirençli 20 A. baumannii suşu çalışmaya dahil edildi. Bu suşlardan DNA izolasyonları gerçekleştirildi ve OXA-23, OXA-24, OXA-51 ve OXA-58 karbapenemazlarının genlerine spesifik primer ve TaqMan probları kullanılarak gerçek zamanlı PCR yöntemiyle OXA karbapenemaz genlerinin dağılımı incelendi. Bulgular: Karbapeneme dirençli A. baumannii suşlarının 16 (%80)’sının duyarlı olduğu tigesiklin bu suşlara bağlı infeksiyonlar için en iyi seçenekti. Tüm suşlarda blaOXA-51 saptanırken, blaOXA-24 sadece 1 (%5) suşta saptandı. Yirmi suştan 10 (%50)’unda blaOXA-23 ve blaOXA-51 birlikteliği vardı. Sonuçlar: Karbapeneme dirençli A. baumannii suşlarındaki OXA tipi karbapenemazların dağılımında blaOXA-23 ve blaOXA-51 birlikteliğinin daha sık olması dikkati çekmiştir. Gerçek zamanlı PCR gibi hızlı ve güvenilir sonuç verebilecek tekniklerle, böyle dirençli suşların rutin sürveyansları yapıldığında değerli epidemiyolojik veriler elde edilebilir. Klimik Dergisi 2019; 32(2): 123-6.
  • Küçük Resim
    Öğe
    Presence Of Biofilm And Adhesin Genes İn Staphylococcus Aureus Strains Taken From Chronic Wound İnfections And Their Genotypic And Phenotypic Antimicrobial Sensitivity Patterns
    (Elsevier, 2020) Demirci, Mehmet; Demir, Cemil; Yiğin, Akın; Tokman, Hrisi Bahar; Yıldız, Songül Çetik
    The purpose of this research was to examine biofilm (icaA, icaD and bap) and adhesin (clfA, fnbA, cna) genes, and also assess the genotypic and phenotypic antimicrobial resistance patterns of Staphylococcus aureus strains taken from wound specimens in Mardin, Turkey. A total of 220 wound specimens were investigated. The biofilm forming ability and resistance pattern for eleven antimicrobial agents were investigated by conventional and multiplex PCR methods. S. aureus were taken from 112 (50.9%) of 220 wound specimens. Moreover, biofilm production was found in 79 (70.5%) of the 112 S. aureus isolates. 97 (86.6%) strains of all isolates were positive for icaA and icaD, and 15 (13.4%) for bap. The adhesin genes, cna, fnbA and clfA were detected in 98 (87.5%), 87 (77.7%), and 75 (66.9%) strains, respectively. The numbers of MSSA and MRSA bearing antimicrobial resistance genes were 19 (16.96%) and 32 (28.57%) for blaZ, 9 (8.04%) and 17 (15.18%) for tetK, 6 (5.36%) and 14 (12.5%) for ermC, 2 (1.79%) and 7 (6.25%) for tetM, 0 (0%) and 5 (4.46%) for mecA, 2 (1.79%) and 4 (3.57%) for ermA, 1 (0.89%) and 2 (1.79%) for both tetK and tetM, respectively. Our findings indicate that multiplex PCR is a suitable way for identifying biofilm and adhesin producing S. aureus. Our data also provided a country-wide oversight of the S. aureus antimicrobial resistance gene profiles for the properly therapy of patients and to control the spreading of the resistance genes.
  • Küçük Resim Yok
    Öğe
    Presence of Staphylococcus aureus, staphylococcal enterotoxins and antimicrobial resistance in traditionally produced raw milk cheeses
    (M H Schaper Gmbh Co Kg, 2018) Gurbuz, Semra; Keskin, Oktay; Gurbilek, Sevil Erdenlig; Tel, Osman Yasar; Yigin, Akin; Demirci, Mehmet; Demir, Cemil
    The objectives of this study was to investigate the presence of Staphylococcus aureus, distribution of classical staphylococcal enterotoxin (SE) SEA to SEE, relevant gene/s and antimicrobial resistance pattern of S. aureus isolated from traditionally produced raw milk cheeses. A total of 106 fresh white cheese samples were examined. The 25 (23.6 %) of 106 cheese samples were found to be contaminated with coagulase positive staphylococci (CPS). From 52 isolates identified as S. aureus, one or more SEs was detected in 38.4 % of the isolates by ELISA whereas one or more se genes were detected in 50 % of the isolates by RT PCR. SEE (75 %) and see gene (61.5 %) were detected most frequently, whereas SED and sed gene were not detected in any isolates. Overall, 63.5 % of isolates were resistant to antimicrobial agents with 59.6 %, 13.5 %, 5.8 %, 5.8 % and 3.8 % of the isolates were resistant to penicillin, erythromycin, tetracycline, cefoxitin and kanamycin, respectively. The results of this study have revealed that cheeses made from raw milk were highly contaminated with S. aureus, therefore, creates a risk for public health due to the presence of enterotoxins as well as resistant strains against antimicrobial agents.